Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B4P23634 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms