Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms