Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms