Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms