Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms