Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNB1P20700 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms