Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms