Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms