Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR1P18146 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms