Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms