Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTLA4P16410 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms