Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB1P16220 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB1P16220 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB1P16220 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB1P16220 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB1P16220 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms