Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSP16219 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSP16219 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSP16219 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms