Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACANP16112 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACANP16112 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACANP16112 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms