Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms