Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGFR1P11362 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGFR1P11362 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms