Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HKR1P10072 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms