Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms