Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP1P09874 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP1P09874 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms