Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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