Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APODP05090 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APODP05090 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APODP05090 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APODP05090 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APODP05090 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APODP05090 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APODP05090 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APODP05090 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms