Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCP02774 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCP02774 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCP02774 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCP02774 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCP02774 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCP02774 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCP02774 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCP02774 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCP02774 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCP02774 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCP02774 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCP02774 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GCP02774 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCP02774 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCP02774 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms