Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOC1P02654 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms