Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGFRP00533 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGFRP00533 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGFRP00533 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms