Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms