Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVILO95425 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVILO95425 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVILO95425 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVILO95425 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVILO95425 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms