Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD4O95243 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms