Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24DO94855 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms