Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms