Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR3O43761 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms