Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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