Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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