Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCAO15360 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCAO15360 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCAO15360 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCAO15360 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCAO15360 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCAO15360 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCAO15360 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms