Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APAF1O14727 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APAF1O14727 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APAF1O14727 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APAF1O14727 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms