Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms