Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms