Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DSR2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DSR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DSR2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DSR2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DSR2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DSR2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DSR2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DSR2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms