Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms