Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms