Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEB3A0JP26 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms