Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RQF3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms