Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEMA3FQ13275 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms