Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms