Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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