Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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