Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms