Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4BQ13620 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4BQ13620 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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