Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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