Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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