Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD39Q53RE8 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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